В письме от 06.11.12 № 03-11-11/332 Минфин разъяснил, что если ИП продает как лекарственные средства, так и  прочие товары, то у него есть право на применение патентной системы налогообложения. При этом ему необходимо приобрести два патента.

Один из патентов (при наличии у ИП соответствующей лицензии) будет по фармацевтической деятельности, к которой согласно Федеральному закону от 12.04.2010 N 61-ФЗ "Об обращении лекарственных средств" относится и розничная продажа лекарств.

Второй патент - по розничной торговле через объекты стационарной торговой сети с площадью торгового зала не более 50 квадратных метров.

При этом возникает вопрос, как рассчитывать площадь торгового зала, ведь для обоих видов деятельности используется одно помещение. Порядок распределения торговой площади в таких случаях не установлен НК.

"В связи с этим при осуществлении на одной и той же площади торгового зала аптеки фармацевтической деятельности и предпринимательской деятельности в сфере розничной торговли, в отношении которых ИП получены отдельные патенты, для определения площади торгового зала в целях применения патента по розничной торговле следует учитывать общую площадь торгового зала аптеки", - пишет Минфин.