На это указала ФНС России в письме от 30.08.2012
Налоговые агенты определяют налоговый статус физического лица на дату фактического получения им дохода в соответствии с положениями статьи 223 НК РФ.
Если физическое лицо самостоятельно декларирует полученный им доход по окончании налогового периода на основании статей 227-229 НК РФ, налоговый статус физического лица рассчитывается по состоянию на окончание налогового периода. При таком расчете не учитываются дни нахождения физического лица на территории РФ до начала отчетного налогового периода или после его окончания.