В письме от 28 декабря 2012 г. N 03-03-05/110 Минфин сообщил, что не установлено особого порядка определения доли прибыли, приходящейся на обособленные подразделения, чья деятельность не включает извлечение дохода. Расчет доли прибыли для таких подразделений производится в общем порядке.

Ведомство также напомнило, что часть налога на прибыль и авансовых платежей по нему, подлежащая зачислению в региональные и местные бюджеты, уплачивается по месту нахождения не только самой организации, но и ее обособленных подразделений. Для этого по каждому подразделению рассчитывается его доля в среднесписочной численности работников (или расходов на оплату труда) в соответствующем показателе по организации в целом, а также- доля в остаточной стоимости амортизируемого имущества. Доля обособленного подразделения в прибыли равна среднему арифметическому этих двух соотношений.

Кроме того, Минфин отметил, что в расчете участвуют также и основные средства, по которым амортизация для целей налогообложения прибыли не начисляется, например, ОС, приобретенные за счет бюджетных средств, числящиеся в составе амортизируемого имущества. При этом остаточной стоимостью признается их первоначальная (восстановительная) стоимость.