В письме от 28.09.2012 № 03-02-07/1-231 Минфин остановился на вопросе зачета налоговым агентом иностранной организации одного налога в счет другого.

Как пишет ведомство, его выводы основываются на п.4 ст.174 НК. Если иностранное лицо реализовало работы (услуги) на территории РФ, налоговый агент уплачивает НДС одновременно в перечислением платы иностранному лицу за его работы (услуги). При этом банк не должен принимать платежку на оплату иностранному контрагенту, если средств на счету российской компании (налогового агента) достаточно для уплаты НДС, но при этом она не представила в банк поручение на уплату НДС.

Уплата НДС налоговым агентом подтверждается поручением по уплате этого налога, и это обстоятельство, по мнению ведомства, исключает осуществление зачета суммы излишне уплаченного налога (в том числе налога на прибыль с дохода иностранной организации) в счет уплаты НДС.